Đảng bộ xã Mỹ Yên có 12 chi bộ với 243 đảng viên, trong đó có chi bộ 1, chi bộ 2, chi bộ 3, chi bộ 4, chi bộ 5, chi bộ 6, chi bộ 7A, chi bộ 7B, chi bộ Công an, chi bộ Quân sự, chi bộ trường Mẫu giáo, chi bộ trường TH& THCS Nguyễn Văn Hiển.

Bí thư Đảng ủy xã: đồng chí Nguyễn quốc Hùng - Huyện ủy viên

Phó bí thư thường trực: đồng chí Nguyễn Văn Minh - Đảng ủy viên

Phó bí thư - CT.UBND: đồng chí Trần Bảo Thành - Đảng ủy viên

Các đồng chí là Đảng ủy viên:

1. Đồng chí Trương Thị Liên Tường

2. Đồng chí Trần Thị Tố Quyên

3. Đồng chí Dương Thị Thanh Thúy

4. Đồng chí Huỳnh Minh Thiện

5. Đồng chí Phạm Hữu Chương

6. Đồng chí Nguyễn Xuân Minh

7. Đồng chí Nguyễn Thị Phương Thào

8. Đồng chí Huỳnh Thị Ngọc Mỹ Dung

9. Đồng chí Trần Thị Minh Thư